In Deutschland ist das größte musiktherapeutische Forschungsinstitut Europas beheimatet, das Deutsche Zentrum für Musiktherapieforschung (Viktor-Dulger-Institut DZM). Am Institut für Musiktherapie der Universität Witten-Herdecke wurde ein Lehrstuhl für qualitative Forschung eingerichtet. Weiters forschen die Universitätsklinik Ulm, die Forschungsstelle Musikmedizin an der Hochschule für Musik und Theater Hamburg und das Internationale Musiktherapie Institut Berlin e.V..

